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偶极分子气液表面性质的分子模拟及研究

时间:2017-12-03 19:43来源:毕业论文
探讨了模拟胞腔的设置方法以及物性的计算和统计方法,选取了适当的分子数,建立了模拟界面的模型分析计算偶极大小。在计算机上成功编译了NAMD并进行测
本文以分子动力学模拟技术为基础,以 CHARM 力场为基础,利用支持CHARM 力场的 NAMD 软件以及辅助软件 VMD,对简单的单原子分子模型在不同温度,不同相态下密度的物理性质,进行了模拟。 首先,探讨了模拟胞腔的设置方法以及物性的计算和统计方法,选取了适当的分子数,建立了模拟界面的模型分析计算偶极大小。在计算机上成功编译了NAMD并进行测试。
其次,以 CHARM 力场为基础,研究了模拟的界面上的结构和性能。在分子模拟得到的性能的基础上,分析了偶极对模拟结果的影响。 16039
关键词  分子动力学模拟  偶极  气液表面性质  界面模拟  密度
Title    Study of molecular dynamics simulation   between gas-liquid phase                                    
 Abstract
In this paper,we analysed the interaction between a model compound for
molecular with the quantum chemical method.As well, we have used CHARM
force field based on the use of gas molecules dissolved NAMD software
polyethylene oxide acts carried out molecular simulations.
Firstly,we explored the way to set up the statistical simulation cell
cavity.And  selected the appropriate number of molecules, the establishment
of a model to simulate the interface analysis calculated dipole size. On
the computer successfully compiled NAMD and tested. 
Secondly, CHARM force field, based on simulations to study the structure
and properties of the interface. On the basis of the performance of the
resulting molecular simulation, we analyze the impact of the dipole of the 源自六-维+论\文"网*加7位QQ3249.114 重庆时时彩的规律 www.mamitama.com
simulation results.
Keywords    molecular dynamics; dipolar; molecular; density
目   次 
1   绪论   1
1.1   量子化学(QM)方法   1
1.2   分子力学(MM)方法    4
1.3   分子蒙特卡罗似(MC)方法.  7
1.4   分子动力学(MD)方法   8
2   分子间的作用力和势能模型   9
2.1   分子间的作用力 .  9
2.2   势能模型 .  9
2.3   多原子体系势能模型的获取 .  13
3   模拟界面技术   15
3.1   体系构成和演化方法 .  15
3.2   模拟胞腔的设置 .  16
3.3   物性计算和统计方法 .  16
4   电偶极子电场分布计算   18
5   分子模拟实验   20
5.1   分子模拟软件简介 .  20
5.2  NAMD 简介    20
5.3  NAMD 的编译    21
5.4   均匀体系模拟 .  23
5.5   模拟小结 .  27
结  论   29
致  谢   30
参考文献   31
 
1  绪论
分子模拟是兴起80年代的一种计算机辅助实验技术,它利用计算机,以原子级
别的模型来描述原子簇或分子结构与行为的计算机模拟手段。近年来,随着计算机技
术(计算机硬件及更高效的算法等)的发展,分子模拟技术高速地发展,并有成为化学
研究领域的日常研究工具的趋势[1]
。分子模拟可以模拟分子的静态结构和分子的动态
行为(如吸附与扩散以及氢键的缔合和解缔等)。分子模拟是一种以计算机上的实验[2]
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,可以直接利用量子化学基本原理对物质的性质进行计算,也可以根据已有的实验数据 偶极分子气液表面性质的分子模拟及研究:重庆时时彩的规律/a/huaxue/20171203/17224.html
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